More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4178 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  61.84 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  62.32 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  57.94 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  56.76 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  54.34 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  51.61 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  46.15 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  46.27 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  38.32 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  37.95 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  36.14 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  34.3 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  34.3 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  36.67 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  32.92 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  34.47 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  37.56 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  35.81 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  36.32 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  39.29 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  40.53 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.06 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  37.02 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  39.18 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  29.67 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  33.01 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  34.03 
 
 		 827 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  34.33 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.14 
 
 		 825 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  28.72 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.51 
 
 		 819 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  31.96 
 
 		 832 aa  85.5  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.38 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.38 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  32.84 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  27.36 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.41 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31.39 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  27.87 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  28.8 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  29.06 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.63 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  27.49 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  26.63 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  29.1 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  28.77 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  28.43 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  32.61 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  31.25 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  28.5 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.93 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.51 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  32.79 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  26.8 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  29.84 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  28.99 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  32.29 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  26.47 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  31.13 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  31.97 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  29.13 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  29.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>