74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3318 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  100 
 
 		 361 aa  734    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  93.06 
 
 		 356 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  59.33 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  28.93 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  29.02 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  28.96 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  29.01 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  29.02 
 
 		 366 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  28.45 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  28.29 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  29.22 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  27.09 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  27.92 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  28.16 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  29.23 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  28.12 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  26.8 
 
 		 366 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  29.48 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  31.85 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  27.01 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  28.14 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  25.23 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  27.01 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  28.61 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  26.72 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  25.53 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  26.63 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  27.88 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  27.57 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  28.17 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  28.17 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  28.21 
 
 		 480 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  26.67 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  26.85 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  26.59 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  26.59 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  24.59 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  26.87 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  28.23 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  29.31 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  27.98 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  25.5 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  25.76 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  26.35 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  26.15 
 
 		 337 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  26.05 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  26.05 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  23.31 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  23.01 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  26.32 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  25 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  29.6 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4124  late control D family protein  29.66 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  23.63 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  26.35 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  28.28 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  26.84 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0570  late control D family protein  26.77 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0355  late control D family protein  29.76 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  26.67 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  23.81 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  22.22 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  27.48 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  27.16 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  26.79 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  28.85 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  22.16 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  21.36 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  25 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  25.25 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  20.6 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  24.92 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  21.38 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  36.62 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>