243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2773 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  99.22 
 
 		 385 aa  757    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 385 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  43.62 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  43.62 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.29 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.19 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  41.19 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.01 
 
 		 539 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.37 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  41.44 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.72 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  37.4 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  41.4 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  41.4 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  37.07 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.11 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  31.67 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.22 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.42 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  27.3 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  28.3 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  27.42 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.61 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  27.97 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.51 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.51 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  26.8 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.51 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.51 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  30.09 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.1 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  25 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  28.96 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.96 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  25.55 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  29.45 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.45 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  25.3 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  23.39 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  24.14 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  26.97 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  24.88 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  27.16 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  26.28 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  26.28 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  26.28 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  27.36 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  27.36 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  27.36 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.39 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  26.23 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.42 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.51 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.42 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.58 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>