More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2689 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  60.36 
 
 		 547 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  65.56 
 
 		 531 aa  703    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  58.71 
 
 		 539 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  92.59 
 
 		 553 aa  1031    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  60.36 
 
 		 547 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  74.76 
 
 		 528 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  74.19 
 
 		 527 aa  840    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  65.23 
 
 		 546 aa  710    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  77.08 
 
 		 528 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  57.86 
 
 		 554 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  58.64 
 
 		 542 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  74.57 
 
 		 527 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  100 
 
 		 527 aa  1093    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  74.9 
 
 		 527 aa  838    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  59.1 
 
 		 523 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  60.36 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  59.37 
 
 		 547 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  58.06 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  35.03 
 
 		 546 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  34.54 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.06 
 
 		 524 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  34.39 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 523 aa  289  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 503 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 509 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  35.93 
 
 		 504 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.92 
 
 		 522 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 503 aa  286  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 		 561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  34.24 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  32.67 
 
 		 529 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  32.22 
 
 		 529 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 		 490 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 498 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 		 527 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  35.58 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 529 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 534 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  32.91 
 
 		 502 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 520 aa  262  8.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 493 aa  260  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  31.66 
 
 		 533 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  33.1 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  26.84 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  28.01 
 
 		 428 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  28.06 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 439 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.63 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.74 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.71 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.16 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  23.23 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 441 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 441 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  26.1 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.68 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 533 aa  100  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 433 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.07 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>