59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0863 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  51.77 
 
 		 723 aa  744    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  47.99 
 
 		 754 aa  682    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  67.08 
 
 		 723 aa  992    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  50.5 
 
 		 834 aa  743    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  52.41 
 
 		 819 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  55.44 
 
 		 742 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  50.14 
 
 		 754 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1524    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  52.36 
 
 		 788 aa  747    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  67.08 
 
 		 746 aa  1037    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  53.75 
 
 		 761 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  51.67 
 
 		 791 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  52.93 
 
 		 771 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  42.23 
 
 		 739 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  42.41 
 
 		 769 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  44.25 
 
 		 792 aa  555  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  40.17 
 
 		 752 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  40.69 
 
 		 785 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  41.35 
 
 		 781 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  47.65 
 
 		 782 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  40.74 
 
 		 752 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  45.5 
 
 		 771 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.67 
 
 		 914 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  40.28 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.03 
 
 		 727 aa  522  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  48.76 
 
 		 543 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  43.94 
 
 		 639 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  43.63 
 
 		 635 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  43.45 
 
 		 612 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  43.34 
 
 		 641 aa  465  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  42.59 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  42.63 
 
 		 632 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  43.73 
 
 		 614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.53 
 
 		 584 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  39.17 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  39.17 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  40.62 
 
 		 594 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  40.29 
 
 		 559 aa  416  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.89 
 
 		 375 aa  99  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 176 aa  89.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  24.78 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  23.79 
 
 		 381 aa  63.9  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  23.53 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  21.05 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.21 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.63 
 
 		 355 aa  51.2  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.77 
 
 		 364 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.81 
 
 		 634 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2204  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.18 
 
 		 368 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1381  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25 
 
 		 773 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0053  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  31.37 
 
 		 598 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  20.45 
 
 		 464 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6101  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  26.89 
 
 		 613 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  27.93 
 
 		 354 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1631  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  29.73 
 
 		 598 aa  44.3  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1916  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.93 
 
 		 597 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.0385848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>