37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5361 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  39.18 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  37.6 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  37.6 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.45 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  38.37 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  33.98 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  30.86 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  34.92 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  28.17 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  31.4 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  24.33 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  29.96 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  32.1 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  31.15 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  27.1 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  27.89 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  31.84 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  24.74 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  35.14 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  32.03 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.51 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  52.08 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3720  Anti-sigma-K factor RskA  34.45 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  38.89 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.86 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  33.04 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.04 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  40.3 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10449  hypothetical protein  29.34 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  22.78 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  41.18 
 
 		 244 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>