More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5054 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
181 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  83.89 
 
 
185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  80.56 
 
 
183 aa  309  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.44 
 
 
183 aa  305  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  77.78 
 
 
183 aa  303  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  79.65 
 
 
184 aa  297  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  79.17 
 
 
184 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  77.78 
 
 
184 aa  290  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  77.33 
 
 
216 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  79.76 
 
 
184 aa  289  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  83.02 
 
 
182 aa  288  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  76.61 
 
 
184 aa  287  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  76.61 
 
 
184 aa  287  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.39 
 
 
226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.13 
 
 
184 aa  281  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.71 
 
 
184 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  81.01 
 
 
184 aa  279  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  73.37 
 
 
182 aa  277  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  79.25 
 
 
199 aa  274  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  77.85 
 
 
184 aa  274  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  76.51 
 
 
264 aa  273  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  72.47 
 
 
226 aa  273  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  71.91 
 
 
226 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  74.7 
 
 
271 aa  270  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  73.12 
 
 
183 aa  260  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  72.78 
 
 
184 aa  260  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.43 
 
 
183 aa  257  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.05 
 
 
183 aa  256  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.54 
 
 
183 aa  245  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.62 
 
 
180 aa  239  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  65.85 
 
 
174 aa  226  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  64.6 
 
 
179 aa  224  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  62.66 
 
 
178 aa  222  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.72 
 
 
179 aa  221  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  64.2 
 
 
167 aa  220  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  64.2 
 
 
167 aa  220  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  64.43 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  62.58 
 
 
213 aa  216  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.43 
 
 
202 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.79 
 
 
170 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.17 
 
 
200 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.89 
 
 
200 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.14 
 
 
170 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
170 aa  200  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 
169 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 
200 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.49 
 
 
170 aa  198  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 
172 aa  197  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 
170 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  195  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 
173 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  51.92 
 
 
182 aa  195  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  51.61 
 
 
168 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
167 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 
187 aa  191  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.72 
 
 
181 aa  191  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.35 
 
 
229 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  49.04 
 
 
180 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.29 
 
 
169 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  49.04 
 
 
180 aa  189  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 
183 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  54.19 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.28 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 
264 aa  188  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54 
 
 
230 aa  187  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
158 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
158 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
268 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  52.5 
 
 
160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  52.5 
 
 
160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
268 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.9 
 
 
158 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.28 
 
 
251 aa  184  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.55 
 
 
158 aa  184  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  54.48 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  52.63 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  54.36 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.71 
 
 
794 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.71 
 
 
794 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>