More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0653 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  100 
 
 		 183 aa  349  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  60.84 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  58.78 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  70.09 
 
 		 432 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  56.95 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  57.14 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  51.01 
 
 		 411 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  57.66 
 
 		 427 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  55.56 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  55.88 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  53.29 
 
 		 438 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  50 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  55.71 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  49.64 
 
 		 415 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  51.37 
 
 		 433 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  49.25 
 
 		 416 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.76 
 
 		 413 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  55.15 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  49.36 
 
 		 203 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  51.66 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  57.36 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  51.08 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  52.48 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  49.38 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  51.77 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  51.74 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  51.47 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  49.64 
 
 		 436 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  47.4 
 
 		 420 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  48.67 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  48.37 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  47.44 
 
 		 420 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  50.35 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  50.77 
 
 		 420 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  70.37 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  50.39 
 
 		 420 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 414 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  45.45 
 
 		 413 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  41.14 
 
 		 408 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.86 
 
 		 414 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 414 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  46.15 
 
 		 413 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  41.5 
 
 		 417 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 408 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  46.81 
 
 		 371 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  45.89 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.87 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  43.33 
 
 		 415 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  44.7 
 
 		 412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  42.25 
 
 		 417 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 413 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  45.21 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  43.57 
 
 		 412 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.84 
 
 		 408 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  50.37 
 
 		 413 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  41.26 
 
 		 415 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 408 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  43.94 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  47.62 
 
 		 421 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 412 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 412 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 425 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  47.62 
 
 		 421 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  47.59 
 
 		 417 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  47.62 
 
 		 421 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  54.07 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  46.21 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  48.98 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  47.55 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  43.18 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  46.67 
 
 		 422 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  43.33 
 
 		 437 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  44.91 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  49.25 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  40.43 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  42.66 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.3 
 
 		 411 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.85 
 
 		 413 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  42.54 
 
 		 412 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  41.96 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  41.55 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  46.43 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>