More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0439 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  66.78 
 
 
290 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  67.35 
 
 
290 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  67.35 
 
 
290 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  67.35 
 
 
290 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  65.05 
 
 
291 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  55.21 
 
 
300 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 
323 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 
321 aa  293  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 
289 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  54.33 
 
 
336 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 
321 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  54.17 
 
 
336 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
337 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  54.01 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  49.48 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  51.76 
 
 
284 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 
294 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  51.81 
 
 
296 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  48.42 
 
 
324 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  48.76 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 
311 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  50.7 
 
 
284 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  50.37 
 
 
356 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 
290 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  51.05 
 
 
284 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  48.95 
 
 
289 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.83 
 
 
639 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  51.76 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  43.89 
 
 
315 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  45.33 
 
 
303 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
293 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 
283 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 
308 aa  255  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  49.28 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
281 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  46.29 
 
 
296 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
323 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  47.87 
 
 
323 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 
296 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 
301 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
283 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
309 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
374 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  42.11 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 
296 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  43.26 
 
 
288 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
290 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 
303 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 
305 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 
335 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
289 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
296 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  42.56 
 
 
297 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  34.46 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  58.91 
 
 
409 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
296 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
275 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
299 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.86 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
298 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
302 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30.34 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
308 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
287 aa  89  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 
318 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  40.98 
 
 
314 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>