More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0315 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  60 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  59.48 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 245 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  45.38 
 
 		 242 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 242 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 242 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.26 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  38.33 
 
 		 242 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 232 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 263 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 247 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  41.04 
 
 		 1888 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 245 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 246 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 246 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 249 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  37.5 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.67 
 
 		 242 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 229 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.3 
 
 		 767 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  94.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 233 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 226 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  43.1 
 
 		 233 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 227 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.6 
 
 		 243 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 326 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 254 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  37.4 
 
 		 254 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 365 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  42.98 
 
 		 326 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  40.83 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  40.95 
 
 		 356 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  45.38 
 
 		 232 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 236 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 741 aa  92  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.21 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 228 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 228 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  35.83 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.34 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  38.32 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.82 
 
 		 2301 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>