More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_08371 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  98.37 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  58.72 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  56.72 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  58.19 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  58.55 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  53.29 
 
 		 306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  52.13 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  52.79 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  52.79 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  45.21 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.08 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.52 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  44.44 
 
 		 313 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 		 310 aa  279  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.21 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  38.46 
 
 		 361 aa  221  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  33.48 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  33.48 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  26.34 
 
 		 404 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  26.23 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  23.91 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  23.02 
 
 		 619 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.6 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  25.98 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  25.78 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  25.39 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.98 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  34.21 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.66 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  23.7 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.08 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.22 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  22.73 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.94 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.61 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  32.46 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.54 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  24.78 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  32.46 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  22.96 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.22 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  24.78 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  23.42 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  24.92 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.02 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.56 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>