More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5841 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  78.66 
 
 
554 aa  803    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.35 
 
 
555 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  64.85 
 
 
544 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  62.48 
 
 
545 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  88.67 
 
 
550 aa  942    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  87.52 
 
 
553 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  87.52 
 
 
553 aa  941    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  75.55 
 
 
569 aa  780    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  73.41 
 
 
553 aa  772    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  76.36 
 
 
550 aa  822    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  87.52 
 
 
553 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  100 
 
 
548 aa  1085    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  62.11 
 
 
545 aa  631  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  62.52 
 
 
542 aa  631  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  64 
 
 
544 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  62.3 
 
 
548 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
549 aa  568  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  55.26 
 
 
537 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  54.71 
 
 
551 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  50.92 
 
 
537 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
543 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
552 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.07 
 
 
575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.56 
 
 
668 aa  264  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.86 
 
 
634 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.16 
 
 
564 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.83 
 
 
540 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.21 
 
 
709 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.7 
 
 
567 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.27 
 
 
543 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 
544 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.77 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.69 
 
 
549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.65 
 
 
543 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.15 
 
 
560 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.27 
 
 
540 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.58 
 
 
641 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.09 
 
 
540 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.72 
 
 
564 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.88 
 
 
659 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.69 
 
 
542 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.11 
 
 
644 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.61 
 
 
672 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.46 
 
 
540 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 
662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 
644 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.83 
 
 
658 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
658 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 
658 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.81 
 
 
644 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 
658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 
658 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 
640 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.47 
 
 
541 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.55 
 
 
643 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.14 
 
 
659 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
659 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.65 
 
 
541 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.89 
 
 
536 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 
636 aa  243  9e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.15 
 
 
639 aa  242  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.09 
 
 
685 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.1 
 
 
548 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.99 
 
 
540 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.19 
 
 
645 aa  242  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.53 
 
 
545 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  31.49 
 
 
632 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.98 
 
 
639 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.53 
 
 
548 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.55 
 
 
517 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
540 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.52 
 
 
630 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 
517 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.21 
 
 
565 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
648 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.34 
 
 
548 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.05 
 
 
540 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.25 
 
 
540 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 
517 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  31.97 
 
 
630 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 
517 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.63 
 
 
690 aa  237  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.05 
 
 
540 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  29.98 
 
 
517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  30.14 
 
 
517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  35.3 
 
 
649 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.3 
 
 
649 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.94 
 
 
634 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.46 
 
 
540 aa  236  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.17 
 
 
539 aa  236  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.07 
 
 
640 aa  236  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
660 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.55 
 
 
636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
660 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  34.8 
 
 
569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.63 
 
 
630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>