More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4484 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  100 
 
 
391 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  72.61 
 
 
405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  72.61 
 
 
405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  72.87 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  71.28 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  62.94 
 
 
393 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  62.89 
 
 
389 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  61.54 
 
 
396 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  61.21 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 
393 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  58.81 
 
 
387 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  59.59 
 
 
368 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  54.48 
 
 
431 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  53.49 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  54.87 
 
 
418 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.95 
 
 
368 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  53.35 
 
 
399 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  52.87 
 
 
430 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  52.82 
 
 
421 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  51.97 
 
 
426 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  53.39 
 
 
380 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  52.84 
 
 
409 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.55 
 
 
382 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
409 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  52.99 
 
 
381 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.21 
 
 
436 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  53.28 
 
 
380 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.9 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.3 
 
 
366 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  50.78 
 
 
366 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.87 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.52 
 
 
369 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
406 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
370 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.91 
 
 
372 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  52.11 
 
 
375 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.26 
 
 
370 aa  359  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.75 
 
 
388 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.24 
 
 
404 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.74 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.13 
 
 
374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.1 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  52.25 
 
 
416 aa  355  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.84 
 
 
367 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.37 
 
 
410 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  52.5 
 
 
408 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
369 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
375 aa  353  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.71 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
406 aa  352  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
349 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.43 
 
 
363 aa  352  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  49.5 
 
 
378 aa  351  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.48 
 
 
384 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.32 
 
 
367 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.32 
 
 
367 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  49.87 
 
 
375 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  50.79 
 
 
362 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.7 
 
 
372 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.01 
 
 
405 aa  348  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 
364 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.92 
 
 
367 aa  347  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 
366 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  54.88 
 
 
355 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.47 
 
 
385 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  46.6 
 
 
365 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  46.6 
 
 
365 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  50.38 
 
 
366 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.12 
 
 
398 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
377 aa  345  7e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.62 
 
 
370 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
364 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.44 
 
 
367 aa  343  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.44 
 
 
367 aa  343  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.49 
 
 
376 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.51 
 
 
349 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.79 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  48.45 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  48.59 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.61 
 
 
369 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
378 aa  342  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
370 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
349 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.96 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  47.25 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  55.26 
 
 
357 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.11 
 
 
379 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  48.71 
 
 
371 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>