More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4001 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  349  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  72.55 
 
 
171 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  58.97 
 
 
170 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  56.86 
 
 
167 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  54.25 
 
 
166 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  56.67 
 
 
161 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  56 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  56 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  53.59 
 
 
184 aa  160  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  50.98 
 
 
162 aa  160  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  52 
 
 
193 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  56.02 
 
 
186 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3777  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.67 
 
 
165 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.06 
 
 
177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.47 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.23 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.21 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.81 
 
 
203 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.05 
 
 
162 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19380  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.45 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.711289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  32.93 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 
790 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  34.15 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
170 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  32.93 
 
 
193 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
330 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.15 
 
 
311 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36 
 
 
179 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.42 
 
 
170 aa  101  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  34.69 
 
 
202 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
226 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.97 
 
 
162 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.95 
 
 
191 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 
404 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.17 
 
 
311 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.01 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
226 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
226 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.72 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  35.21 
 
 
327 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  35.81 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 
311 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  36.3 
 
 
306 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  38.76 
 
 
302 aa  94.4  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
311 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  35.81 
 
 
318 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  36.94 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  36.94 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.64 
 
 
311 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  30.52 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  33.55 
 
 
408 aa  91.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.01 
 
 
190 aa  91.3  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  34.15 
 
 
204 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.12 
 
 
190 aa  90.9  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
169 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
169 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.25 
 
 
178 aa  90.5  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  37.01 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  31.82 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35 
 
 
169 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
161 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
393 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  35.8 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.48 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  34.44 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  36.81 
 
 
320 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.74 
 
 
177 aa  87.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.26 
 
 
204 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
161 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
188 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
188 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  37.27 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.95 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  37.27 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  37.27 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34.39 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.02 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>