246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1387 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  527  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  68.05 
 
 
266 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  49.06 
 
 
272 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  46.82 
 
 
279 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  46.82 
 
 
279 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  46.82 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
280 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  37.73 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  37.73 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  37.73 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 
274 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  37.35 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  37.35 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  33.46 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  37.35 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  39.06 
 
 
268 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  34.34 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31 
 
 
289 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.06 
 
 
299 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
341 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  27.7 
 
 
341 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
341 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.32 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  28.94 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  27.37 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.44 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  26.79 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.68 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  29.41 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.74 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  27.7 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  26.82 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.89 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  28.25 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
289 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  36.75 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.89 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.34 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.49 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.13 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  31.94 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  30.2 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  28.63 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.59 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.36 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  36.55 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  27.99 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.38 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.28 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  24.91 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  34.35 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  29.52 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  33.64 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  30.19 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  25.4 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  30.89 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  29.45 
 
 
321 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.6 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  28.88 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  37.78 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  27.65 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32.04 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>