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for query gene Msil_3899 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3899  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 402 aa  767    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2102  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.02 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.84 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.84 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.81 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.59 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.73 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  37.22 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.23 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.9 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.63 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.01 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.9 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.66 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.68 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.05 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.34 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.07 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.82 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.92 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  34.11 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.11 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.93 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.43 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.27 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.53 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  31.76 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  31.76 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.63 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.84 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.54 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.5 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.9 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.08 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.61 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  30 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.63 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.69 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.41 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.05 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.84 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.51 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.51 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.27 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.01 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.56 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.43 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  30.67 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  33.16 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.38 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.67 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.41 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.97 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.7 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.06 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.57 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.58 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.9 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 		 458 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.05 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 434 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.54 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.64 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.26 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.75 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.52 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.4 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.07 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.53 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.4 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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