More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1805 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  58.68 
 
 		 254 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  61.18 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  53.02 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.56 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  37.3 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  33.74 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  33.47 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.3 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 228 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  31.74 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  34.88 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.33 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  36.67 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  38.38 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.36 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.51 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.78 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  30.15 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  30.15 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  35.83 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  33.48 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  33.87 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.56 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.51 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.8 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.36 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.92 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  32.72 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  40.1 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.7 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  30.04 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.07 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.89 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  33.95 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  33.66 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.13 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.17 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  35.45 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  30.96 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  31.58 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.94 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  34.24 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  27.5 
 
 		 237 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.52 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.19 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  37.37 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  33.87 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  32.75 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  43.65 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  33.83 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  37.62 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.18 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.45 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.92 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  30.53 
 
 		 239 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  29.63 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>