More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1446 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  68.13 
 
 
747 aa  936    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
760 aa  1488    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  59.92 
 
 
759 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  56.39 
 
 
751 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  59.55 
 
 
735 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  56.59 
 
 
662 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 
686 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  47.96 
 
 
686 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  47.96 
 
 
686 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
751 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  73.45 
 
 
758 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  73.2 
 
 
763 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  45.49 
 
 
711 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  46.46 
 
 
748 aa  558  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.58 
 
 
720 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
688 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
677 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
686 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  61.42 
 
 
684 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  38.42 
 
 
669 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
682 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
707 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
684 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  37.83 
 
 
662 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  37.48 
 
 
681 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.53 
 
 
703 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  37.38 
 
 
717 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
724 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.89 
 
 
727 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 
717 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
728 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
695 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  36.75 
 
 
708 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
724 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 
729 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.96 
 
 
806 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
712 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
709 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
686 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  36.94 
 
 
707 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  51.43 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 
654 aa  399  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  51.43 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  51.43 
 
 
652 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  51.43 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  51.43 
 
 
654 aa  399  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
682 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  51.43 
 
 
652 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  51.43 
 
 
654 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  51.69 
 
 
654 aa  399  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  50 
 
 
669 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  51.79 
 
 
761 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
709 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  50 
 
 
669 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  50 
 
 
669 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  50 
 
 
669 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  50 
 
 
669 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  51.27 
 
 
772 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 
743 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  50.5 
 
 
673 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  51.79 
 
 
750 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
702 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
694 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  50 
 
 
715 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  51.79 
 
 
756 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  52.06 
 
 
744 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  51.79 
 
 
756 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
698 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  50.39 
 
 
655 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  51.42 
 
 
767 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  50 
 
 
784 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
694 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
699 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  50.76 
 
 
749 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 
684 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 
671 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  49.36 
 
 
674 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  48.88 
 
 
672 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  51.42 
 
 
767 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 
766 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  51.42 
 
 
767 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  51.42 
 
 
767 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
749 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  50.38 
 
 
766 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  36.15 
 
 
701 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  51.3 
 
 
765 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  51.3 
 
 
765 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  51.3 
 
 
762 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
722 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.87 
 
 
691 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  51.16 
 
 
664 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 
671 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.08 
 
 
741 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
724 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
724 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  50.39 
 
 
669 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  51.71 
 
 
625 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  51.03 
 
 
639 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
702 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  47.02 
 
 
783 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>