More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1400 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  100 
 
 		 334 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60.18 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.39 
 
 		 343 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  34.94 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.09 
 
 		 375 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.22 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.34 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.28 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.01 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.66 
 
 		 371 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  33.15 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  31.32 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.06 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  35.25 
 
 		 373 aa  165  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.88 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.45 
 
 		 357 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.78 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.43 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.54 
 
 		 376 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.18 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.88 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  30.05 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  31.3 
 
 		 416 aa  142  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  28.99 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  28.99 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  28.99 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  29.23 
 
 		 405 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  31.82 
 
 		 414 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  33.1 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  28.04 
 
 		 404 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  28.8 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  30.99 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  30.16 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  28.84 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  29.49 
 
 		 427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.04 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  29.93 
 
 		 430 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  30.25 
 
 		 418 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  28.2 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  30.72 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  28.96 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.32 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  31.06 
 
 		 429 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  30.49 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  27.47 
 
 		 434 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  28.94 
 
 		 432 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  28.94 
 
 		 432 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  28.43 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  31.63 
 
 		 428 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  30.36 
 
 		 414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  27.97 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  27.79 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  29.43 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  27.61 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  31.05 
 
 		 429 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  31.58 
 
 		 421 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  29.1 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  29.95 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.06 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  30.45 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  28.73 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.27 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  28.94 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  28.65 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  29.07 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  28.93 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.67 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28.24 
 
 		 402 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  26.4 
 
 		 412 aa  115  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.04 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  30.18 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  27.03 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.74 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.52 
 
 		 408 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  28.44 
 
 		 424 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  30.62 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  30.91 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  30.6 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  28.02 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  29.97 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7498  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.61 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  30.9 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  31.16 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  28.52 
 
 		 403 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  31.92 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  29.64 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  31.15 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  27.32 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  31.7 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  30.82 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  30.94 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  31.7 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  31.37 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.09 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  27.13 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  31.56 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  31.7 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  30.28 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  30.77 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>