More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2598 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  65.93 
 
 
183 aa  234  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  54.84 
 
 
197 aa  197  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  50 
 
 
195 aa  184  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  47.09 
 
 
193 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  50.54 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.4 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  46.2 
 
 
190 aa  167  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  48.09 
 
 
188 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  45.83 
 
 
219 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  46.03 
 
 
202 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  46.84 
 
 
192 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  46.52 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  47.83 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.32 
 
 
199 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  44.62 
 
 
183 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  44.39 
 
 
182 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  46.6 
 
 
360 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  46.32 
 
 
195 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.63 
 
 
211 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  44.81 
 
 
187 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.23 
 
 
423 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  46.49 
 
 
191 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  44.09 
 
 
199 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  44.86 
 
 
189 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  45.5 
 
 
194 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  45.5 
 
 
194 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  42.38 
 
 
213 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  43.85 
 
 
182 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  45.74 
 
 
186 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  43.32 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  45.99 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  39.81 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  43.72 
 
 
192 aa  154  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  41.59 
 
 
218 aa  154  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  44.26 
 
 
192 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  40.19 
 
 
215 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  45.5 
 
 
367 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  46.28 
 
 
191 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  40.95 
 
 
214 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  41.63 
 
 
215 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  44.97 
 
 
194 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  44.21 
 
 
206 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  40.57 
 
 
217 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  42.65 
 
 
215 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  43.13 
 
 
216 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  41.43 
 
 
214 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  42.39 
 
 
367 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  43.33 
 
 
374 aa  152  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  44.15 
 
 
195 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  43.92 
 
 
205 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  43.69 
 
 
208 aa  151  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  44.09 
 
 
182 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  42.71 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  43.46 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  42.56 
 
 
208 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  44.74 
 
 
341 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  40.28 
 
 
213 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  49.21 
 
 
204 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  37.26 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  37.26 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  45.11 
 
 
184 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  43.69 
 
 
208 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  41.87 
 
 
219 aa  148  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  41.47 
 
 
229 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  44.51 
 
 
200 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  44.32 
 
 
187 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0495  adenylate kinase  40.57 
 
 
216 aa  148  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_437  adenylate kinase  40.57 
 
 
216 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000304823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  44.44 
 
 
197 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  42.29 
 
 
194 aa  147  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  40 
 
 
215 aa  147  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  44.02 
 
 
187 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  43.78 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  39.05 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  44.75 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  43.62 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  37.74 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  39.13 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  42.33 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  39.81 
 
 
217 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  44.21 
 
 
205 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0472  adenylate kinase  39.15 
 
 
216 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00114674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  42.63 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  45.11 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  40 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  40.58 
 
 
213 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  40.19 
 
 
216 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  44.81 
 
 
193 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  40.74 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  41.43 
 
 
217 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  41.43 
 
 
217 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  41.43 
 
 
217 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  43.02 
 
 
389 aa  144  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  40.45 
 
 
218 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  45.65 
 
 
195 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  43.24 
 
 
199 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>