More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1234 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  47.2 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  46.26 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  46.23 
 
 
215 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  42.92 
 
 
216 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  45.62 
 
 
215 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  47.6 
 
 
213 aa  188  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  43.4 
 
 
216 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  43.4 
 
 
216 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  45.67 
 
 
214 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  184  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  45.45 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.79 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  44.81 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  52.36 
 
 
208 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.87 
 
 
216 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.46 
 
 
215 aa  182  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.7 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.37 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  46.7 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  44.81 
 
 
214 aa  181  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.91 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  41.51 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  46.92 
 
 
208 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  43.93 
 
 
214 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.13 
 
 
217 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  44.34 
 
 
216 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  43.98 
 
 
217 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  41.04 
 
 
215 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  41.04 
 
 
215 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  43.46 
 
 
214 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.69 
 
 
213 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  43.4 
 
 
214 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  42.99 
 
 
217 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  44.34 
 
 
217 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  42.92 
 
 
213 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  45.37 
 
 
211 aa  175  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  42.99 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.85 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.78 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  45.85 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  44.56 
 
 
213 aa  171  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.75 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  43.32 
 
 
219 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.58 
 
 
211 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  41.47 
 
 
216 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  40.85 
 
 
217 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  43.19 
 
 
217 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  41.83 
 
 
216 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  42.2 
 
 
224 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  41.31 
 
 
214 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  40.09 
 
 
213 aa  168  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.88 
 
 
423 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  41.59 
 
 
218 aa  168  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  41.12 
 
 
214 aa  168  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  41.31 
 
 
214 aa  168  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  40.62 
 
 
220 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  39.62 
 
 
215 aa  168  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  44.5 
 
 
208 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  40.89 
 
 
221 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  41.83 
 
 
216 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  41.04 
 
 
222 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.19 
 
 
217 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  40.28 
 
 
215 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  40.87 
 
 
216 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  40.87 
 
 
216 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  41.35 
 
 
216 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  42.33 
 
 
225 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  42.73 
 
 
222 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  42.34 
 
 
218 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  41.59 
 
 
215 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.16 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  41.63 
 
 
209 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  40.38 
 
 
216 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  40.93 
 
 
218 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  42.18 
 
 
220 aa  165  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  42.18 
 
 
220 aa  165  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  42.86 
 
 
214 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  40.89 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  42.25 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  40.62 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  40.62 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  40.62 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  44.98 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  42.33 
 
 
218 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  40.87 
 
 
216 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  40.87 
 
 
216 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  40.87 
 
 
216 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  42.92 
 
 
220 aa  164  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>