More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1847 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  84.58 
 
 		 201 aa  342  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  62.76 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  51.27 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.07 
 
 		 201 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.96 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.69 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.33 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  43.46 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.31 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.21 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.07 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  42.49 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.5 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  42.49 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.22 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.93 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.98 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.78 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.86 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.12 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.19 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.93 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.62 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  43.93 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  44.23 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  44.23 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  39.47 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  36.63 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  39.69 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  36.78 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.77 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  43.45 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  37.95 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  38.81 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  37.19 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  37.71 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  38.29 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  37.14 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  36.46 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  37.57 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  34.83 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.35 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  38.95 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  37.24 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  37.24 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  35.87 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  33.66 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  34.48 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.57 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  33.84 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  36.98 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  39.61 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  39.61 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  38.96 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  35.5 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  34.48 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  34 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  41.62 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  34.5 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  38.96 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  34 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  34 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  34.74 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.05 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  37.63 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  40.46 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  37.66 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  34.91 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  34.54 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>