More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5920 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  825    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  35.71 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  31.19 
 
 		 461 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  33.49 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  34.4 
 
 		 454 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  34.17 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  34.17 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  31.19 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  31.48 
 
 		 468 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2275  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  30.43 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  30.21 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  30.21 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.65 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  32.79 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  33.64 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  35.25 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.81 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.95 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  31.78 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  33.33 
 
 		 449 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  32.34 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  30.17 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  29.68 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  30.8 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  30.17 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  30.17 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  33.01 
 
 		 485 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.58 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.06 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  29.93 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  29.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  29.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  29.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  29.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.84 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  33.17 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  29.93 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  29.38 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  29.18 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.04 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  32.12 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  32.12 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  32.85 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  28.92 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  32.48 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  32.48 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  34.19 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  31.58 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  31.13 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  28.47 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.09 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.92 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  32.69 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  32.69 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  33.41 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  32.76 
 
 		 435 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>