41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5619 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  38.94 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  41.97 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  43.55 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  41.53 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  39.31 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  40.6 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  40.13 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  38.15 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  41.22 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  39.81 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  35.62 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  38.49 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  40.72 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  44.79 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  23.71 
 
 		 457 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.41 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.52 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  22.06 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  31.65 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21.37 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.83 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  26.13 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  31.37 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  31.65 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  31.65 
 
 		 385 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.5 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.07 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  26.23 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.66 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  22.07 
 
 		 719 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.99 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.92 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  31.25 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  30.56 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  26.87 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  21.59 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  25.49 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>