298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4966 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  84.97 
 
 		 178 aa  310  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  63.69 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  61.78 
 
 		 165 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  61.78 
 
 		 165 aa  184  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  52.26 
 
 		 158 aa  167  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  49.35 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  50.65 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  47.85 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.75 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.75 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.1 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.1 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.1 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.58 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.1 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.05 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.1 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  50.75 
 
 		 137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  47.68 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  48.34 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  51.7 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  43.56 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  40.13 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  42.55 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  41.84 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  39.39 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  40.44 
 
 		 158 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  33.54 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.66 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  35.22 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  40.15 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  34.21 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  26.76 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  31.82 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.04 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.93 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  32.05 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  35.56 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  31.41 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  27.34 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  27.78 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  29.61 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  31.58 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.21 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  31.87 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  32.89 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  31.16 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  31.58 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.67 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.82 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  34.9 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  32.74 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  30.06 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.75 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  31.4 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  30.06 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  24.82 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.94 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  31.33 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  28.74 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  36 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  30.3 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1007  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000417109  normal  0.0215471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  33.33 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  32.62 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  31.29 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>