More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3693 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  100 
 
 
315 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  57.76 
 
 
329 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  59.13 
 
 
331 aa  315  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  59.13 
 
 
331 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  56.96 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  57.23 
 
 
330 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  43.81 
 
 
308 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  44.81 
 
 
303 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  45.08 
 
 
308 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 
311 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  43.09 
 
 
308 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  41.69 
 
 
324 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  39.26 
 
 
326 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  38.99 
 
 
311 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.87 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  38.87 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  37.45 
 
 
276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  37.05 
 
 
255 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  36.25 
 
 
276 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  32.5 
 
 
456 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  40.66 
 
 
241 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.83 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  38.1 
 
 
274 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  40.95 
 
 
456 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  39.18 
 
 
272 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  39.59 
 
 
272 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
439 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.69 
 
 
561 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.69 
 
 
561 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  34.3 
 
 
447 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  36.07 
 
 
436 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
436 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  31.63 
 
 
417 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.23 
 
 
577 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.23 
 
 
577 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
438 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 
444 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.57 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  29.48 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  26.22 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
225 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.68 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
246 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
246 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.84 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  36.45 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
246 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.94 
 
 
251 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  36.94 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  36.94 
 
 
251 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.82 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  36.04 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  25.43 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  36.04 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.62 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
232 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
241 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36 
 
 
241 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.89 
 
 
243 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 
254 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.17 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  29 
 
 
208 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 
252 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.5 
 
 
251 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.46 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  29.94 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  35.25 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 
251 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 
251 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
279 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
279 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>