81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2184 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2184  CheW protein  100 
 
 		 190 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2955  CheW protein  52.41 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3063  CheW protein  51.03 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2837  CheW domain-containing protein  50.34 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  44.03 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  35.23 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.68 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  26.53 
 
 		 302 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  32.95 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  23.37 
 
 		 907 aa  51.2  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  25.53 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  25.95 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  25.55 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  23.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  25.51 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  22.22 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  42.31 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.65 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  42.31 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  42.31 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.65 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  26.06 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  25.34 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  25.81 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  26.29 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  22.6 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  22.66 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.67 
 
 		 161 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  32.28 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.73 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  36.49 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  33.78 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.95 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  28.57 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  25.93 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  33.8 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  38.78 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  35.8 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  25.98 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  28.28 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  30.61 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.76 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.48 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  30.95 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  25.98 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  26.67 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  30.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.24 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  24.44 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  32.11 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  27.97 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  31.31 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.36 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  27.1 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.57 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  38.1 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.48 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  25 
 
 		 141 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  35.42 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.53 
 
 		 165 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  23.14 
 
 		 151 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.53 
 
 		 165 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.93 
 
 		 164 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  30.28 
 
 		 158 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  27.03 
 
 		 159 aa  42  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  34.43 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  38.96 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  26.67 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26.57 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  23.47 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  25.47 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  30.69 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.48 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.17 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>