More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2068 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  71.03 
 
 		 585 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  75 
 
 		 586 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  100 
 
 		 583 aa  1112    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  74.57 
 
 		 596 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  73.61 
 
 		 585 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  75.69 
 
 		 596 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  44.66 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 611 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  43.95 
 
 		 628 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 599 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  44.08 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  40.69 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  44.23 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  40.17 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  37.67 
 
 		 625 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  35.87 
 
 		 599 aa  359  9e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  39.09 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  36.46 
 
 		 614 aa  327  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  36.81 
 
 		 600 aa  293  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  33.75 
 
 		 571 aa  276  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  35.48 
 
 		 613 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.5 
 
 		 564 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.08 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.35 
 
 		 564 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.51 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 564 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  38.48 
 
 		 626 aa  251  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  30.49 
 
 		 610 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  30.14 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  27.8 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  33.62 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  30.66 
 
 		 607 aa  230  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 613 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  30.52 
 
 		 612 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  25.55 
 
 		 552 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  31.16 
 
 		 611 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  31.81 
 
 		 610 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  31.16 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  36.92 
 
 		 606 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.57 
 
 		 613 aa  220  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  26.7 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  30 
 
 		 592 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.05 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  31.34 
 
 		 605 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  42.6 
 
 		 590 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  44.96 
 
 		 591 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  31.37 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  44.21 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  46.12 
 
 		 602 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  36.38 
 
 		 572 aa  204  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.08 
 
 		 586 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  44.78 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.22 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.58 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  44.78 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33.62 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  41.25 
 
 		 727 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  49.11 
 
 		 603 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  47.98 
 
 		 601 aa  200  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.83 
 
 		 567 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.88 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.83 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.88 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  35.88 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  45.65 
 
 		 601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  30.81 
 
 		 610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  44.77 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  43.98 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 720 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  43.98 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  46.96 
 
 		 720 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.51 
 
 		 595 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  48.85 
 
 		 991 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  48.85 
 
 		 981 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  30.49 
 
 		 600 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.93 
 
 		 582 aa  197  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  35.07 
 
 		 607 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 578 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  44.03 
 
 		 624 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  43.04 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  31.39 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 575 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 620 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  43.29 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  44.25 
 
 		 578 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.07 
 
 		 612 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  43.24 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  40.76 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  41.8 
 
 		 578 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.24 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.1 
 
 		 587 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  46.22 
 
 		 1018 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  44.08 
 
 		 610 aa  193  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  29.34 
 
 		 593 aa  193  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  45.99 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>