242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2043 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1198  methylmalonyl-CoA epimerase  85.82 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1003  methylmalonyl-CoA epimerase  85.07 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1069  methylmalonyl-CoA epimerase  85.82 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17549  normal  0.247158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  83.46 
 
 
134 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  82.71 
 
 
134 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1572  methylmalonyl-CoA epimerase  79.7 
 
 
134 aa  226  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  79.85 
 
 
134 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  77.44 
 
 
134 aa  219  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  76.87 
 
 
134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  77.61 
 
 
134 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.37 
 
 
134 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  75.37 
 
 
134 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  75.37 
 
 
134 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.63 
 
 
134 aa  211  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  72.18 
 
 
134 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1369  methylmalonyl-CoA epimerase  71.43 
 
 
134 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  70.9 
 
 
134 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  73.68 
 
 
134 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  70.9 
 
 
134 aa  203  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  70.9 
 
 
134 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0906  methylmalonyl-CoA epimerase  68.66 
 
 
134 aa  200  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61726  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  67.91 
 
 
134 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  70.9 
 
 
134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  71.43 
 
 
136 aa  194  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.17 
 
 
134 aa  189  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.295419  normal  0.1439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4545  methylmalonyl-CoA epimerase  66.17 
 
 
134 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0847692  normal  0.36006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.17 
 
 
134 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2590  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.17 
 
 
134 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.66 
 
 
134 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.132451  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2869  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.41 
 
 
134 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15489  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3282  methylmalonyl-CoA epimerase  65.41 
 
 
134 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3210  methylmalonyl-CoA epimerase  63.16 
 
 
134 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0791094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  67.67 
 
 
133 aa  174  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  57.58 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  57.14 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  52.99 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6135  methylmalonyl-CoA epimerase  53.03 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00511607  normal  0.152762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.23 
 
 
146 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.019887  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  48.87 
 
 
134 aa  120  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  47.45 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  46.27 
 
 
134 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
134 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  43.61 
 
 
134 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  43.28 
 
 
137 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
134 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  41.79 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  38.52 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  40.6 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  39.1 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  39.39 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  37.4 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.96 
 
 
134 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.06 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  39.1 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  42.97 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 
135 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  41.18 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  45.19 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  36.3 
 
 
135 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  45.19 
 
 
134 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  44.44 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  37.14 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  40.16 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  35.16 
 
 
134 aa  87  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  37.68 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  43.85 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  34.53 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  36.09 
 
 
139 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.64 
 
 
140 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  35.51 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  36.09 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  38.69 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  36.09 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  34.56 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  35.34 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  35.16 
 
 
136 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  36.92 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  36.64 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  38.24 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  34.11 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  39.53 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  34.59 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  34.59 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  34.59 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>