More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0234 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0234  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4032  LysR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 297 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124672  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1674  LysR substrate-binding  55.56 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1992  transcriptional regulator, LysR family  55.56 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4113  transcriptional regulator, LysR family  56.74 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0816  transcriptional regulator, LysR family  54.17 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6667  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6432  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6341  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6265  LysR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.05074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0548  transcriptional regulator, LysR family  55.17 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3021  transcriptional regulator, LysR family  52.61 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6210  transcriptional regulator, LysR family  51.23 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  34.03 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.69 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3407  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  34.35 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2713  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0846  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.579018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3521  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0814  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116496  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0839  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.771385  hitchhiker  0.0000128794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  28.77 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0451  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>