More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4494 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  95.8 
 
 		 547 aa  1083    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  59.96 
 
 		 527 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  61.08 
 
 		 528 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  61.28 
 
 		 553 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 547 aa  1136    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  79.71 
 
 		 542 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  60.66 
 
 		 527 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  95.98 
 
 		 547 aa  1085    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  77.65 
 
 		 543 aa  887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  60.19 
 
 		 528 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  59.88 
 
 		 527 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  58.93 
 
 		 531 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  58.67 
 
 		 523 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  89.95 
 
 		 547 aa  1009    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  57.78 
 
 		 539 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  57.93 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  58.53 
 
 		 527 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  58.51 
 
 		 546 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  38.08 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  36.23 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.36 
 
 		 522 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 498 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 534 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  33.96 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  32.61 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  33.69 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  32.14 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  32.7 
 
 		 533 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.53 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 		 529 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 502 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 527 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 521 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 529 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 		 561 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  35.08 
 
 		 532 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  26.98 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  27.89 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.63 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.18 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 428 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.5 
 
 		 479 aa  117  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  26.42 
 
 		 428 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  26.63 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 448 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 474 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 470 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.66 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.69 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.25 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 467 aa  100  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.66 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>