68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2300 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  90.73 
 
 
258 aa  470  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  90.35 
 
 
258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  69.96 
 
 
256 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  67.07 
 
 
257 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  66.14 
 
 
254 aa  334  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  53.33 
 
 
289 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  54.12 
 
 
258 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  55.16 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  51 
 
 
262 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  53.04 
 
 
255 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  53.04 
 
 
292 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  48.8 
 
 
276 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  46.56 
 
 
253 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  46.15 
 
 
253 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  44.53 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  44.31 
 
 
264 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  42.68 
 
 
251 aa  191  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  44.22 
 
 
264 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  42.97 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  40.69 
 
 
312 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  43.18 
 
 
288 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  35.02 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32.26 
 
 
252 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 
587 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  33.2 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  29.32 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  31.91 
 
 
245 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.08 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  27.74 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  27.74 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  31.89 
 
 
247 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  31.5 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  29.26 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  29.17 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  28.91 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  26.81 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  26.45 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  25.37 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  26.61 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  26.18 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  26.52 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  29.82 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  26.94 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  28.04 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.34 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  28.16 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  28.7 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  28.51 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  33.62 
 
 
366 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  28.51 
 
 
285 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.92 
 
 
285 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  24.32 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  29.32 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  28.99 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  25.36 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  24.14 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  37.21 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  27.73 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  26.82 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  24.29 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  26.89 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10746  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07820)  30.59 
 
 
419 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.673358  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  25.27 
 
 
369 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  28.52 
 
 
347 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>