More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2030 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  74.5 
 
 		 400 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  76 
 
 		 400 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 400 aa  833    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  76 
 
 		 400 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  97.25 
 
 		 400 aa  816    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  85.96 
 
 		 400 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  74.5 
 
 		 400 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  86.5 
 
 		 400 aa  732    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  76.5 
 
 		 400 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  76 
 
 		 400 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  96.75 
 
 		 400 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  85.75 
 
 		 400 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  76.5 
 
 		 400 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  75.75 
 
 		 400 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  71.93 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  72.18 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  70.75 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  70.68 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  69.67 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  70.25 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  68.5 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  68.75 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  69 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  69.5 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  68.25 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  68.25 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  68.5 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  68 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  66.17 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  64.91 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  63.91 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  63.91 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  63.5 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  63.16 
 
 		 400 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  63 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  63.91 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  63.96 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  60.25 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  56 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  57.58 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  55.5 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  54.68 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  54.39 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  58.5 
 
 		 400 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  56.06 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  56.23 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  56.67 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  56.41 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  56.06 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  54.77 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  53.49 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  53.85 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  54.9 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  55 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  51.63 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  51.63 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  51.13 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  52.85 
 
 		 413 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  52.55 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  53.11 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  51.75 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  53.9 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  51.65 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  51.02 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  49.75 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.11 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  51.4 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  49.23 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  47.61 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  50 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  48.61 
 
 		 397 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  50.25 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  50.9 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  49.24 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  48.72 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.85 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  45.84 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.6 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  47.1 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  48.83 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  48.08 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  49.09 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  44.99 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  46.53 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  48.25 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  45.64 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  47.24 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>