More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1773 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 544 aa  1051    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1822  ATPase domain-containing protein  91.19 
 
 		 545 aa  941    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2157  histidine kinase  91.19 
 
 		 545 aa  941    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.6 
 
 		 548 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.27335  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  62.05 
 
 		 526 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.48 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 537 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 558 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03102  two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.53 
 
 		 551 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  32.13 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 425 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  29.2 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 597 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.95 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  28.03 
 
 		 560 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 597 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.96 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 835 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.15 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.89 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 639 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  31.44 
 
 		 347 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  30 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  30.55 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 613 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0991  sensor histidine kinase  31.05 
 
 		 549 aa  114  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000699146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  30.06 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  32.83 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  31 
 
 		 1366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.99 
 
 		 1301 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.06 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.33 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.11 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 977 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.41 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 416 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 416 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.6 
 
 		 496 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 909 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  24.27 
 
 		 787 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  27.3 
 
 		 925 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.84 
 
 		 582 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  32.12 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  28.31 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 471 aa  108  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.73 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 640 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1207 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.83 
 
 		 343 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  23.72 
 
 		 355 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  28.4 
 
 		 608 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.59 
 
 		 917 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 608 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  33.05 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 483 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  26.44 
 
 		 925 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 978 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.43 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  33.95 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  33.02 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 737 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.43 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  29.22 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.06 
 
 		 923 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  33.49 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>