More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0692 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  93.04 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  93.56 
 
 		 233 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  52.63 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  40.43 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  40.43 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  40 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  45.65 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  40.43 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  39.91 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  40.77 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  39.06 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  40.77 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  38.2 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  38.33 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  36.91 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  36.32 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  35.47 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  40.26 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  35.04 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  34.76 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  37.07 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  36.48 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.08 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  37.56 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  32.76 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  37.87 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.94 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  31.44 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.16 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  36.99 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  30.64 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.63 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.63 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.83 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  29.46 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.85 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  34.64 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  30.59 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  31.88 
 
 		 522 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  35.07 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  31.77 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  28.71 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.98 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  34.81 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.56 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  28.99 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  31.33 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  30.29 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  30.95 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  30.53 
 
 		 522 aa  62  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  32.28 
 
 		 560 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  30 
 
 		 516 aa  62  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  35.61 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  27.56 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  29.29 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  30.18 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  30.33 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  35.66 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  28.82 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  27.49 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.1 
 
 		 536 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.72 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  33.33 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  37.01 
 
 		 512 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.51 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  27.87 
 
 		 540 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  27.72 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  27.81 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  28.91 
 
 		 542 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  27.72 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  32.81 
 
 		 510 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.38 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  28.28 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.06 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  28.65 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>