More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1779 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  100 
 
 
677 aa  1363    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  39.62 
 
 
648 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  39.97 
 
 
648 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  39.79 
 
 
648 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  37.87 
 
 
644 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  34.44 
 
 
655 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  31.73 
 
 
660 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  32.44 
 
 
697 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  35.09 
 
 
641 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  30.03 
 
 
676 aa  296  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  30.36 
 
 
701 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  30.95 
 
 
702 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  29.7 
 
 
681 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  29.94 
 
 
676 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  28.69 
 
 
681 aa  259  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  30.48 
 
 
681 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  29.79 
 
 
700 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  29.86 
 
 
694 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  28.99 
 
 
683 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  30.81 
 
 
692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  29.7 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  31.09 
 
 
694 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  28.51 
 
 
678 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  30.27 
 
 
680 aa  244  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  30.06 
 
 
701 aa  244  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  29.94 
 
 
694 aa  243  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  30.86 
 
 
680 aa  243  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  28.89 
 
 
682 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  28.41 
 
 
685 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  31.8 
 
 
579 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  27.8 
 
 
679 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  28.94 
 
 
683 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  29.47 
 
 
681 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  31.67 
 
 
694 aa  241  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  241  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  29.79 
 
 
681 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  29.9 
 
 
680 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  28.01 
 
 
679 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  31.36 
 
 
682 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  27.68 
 
 
683 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  27.36 
 
 
658 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  27.18 
 
 
683 aa  237  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  29.14 
 
 
692 aa  237  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  29.54 
 
 
695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  29.66 
 
 
694 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  29.48 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  29.73 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  29.63 
 
 
712 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  29.48 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  28.41 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  32.4 
 
 
685 aa  235  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  29.48 
 
 
680 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  29.48 
 
 
680 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  27.85 
 
 
679 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  29.48 
 
 
680 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  31.63 
 
 
694 aa  235  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  30 
 
 
680 aa  235  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  29.54 
 
 
695 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  29.54 
 
 
683 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  27.7 
 
 
679 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  30.77 
 
 
686 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  29.97 
 
 
701 aa  233  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  27.7 
 
 
679 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  27.7 
 
 
679 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  28.83 
 
 
695 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  29.77 
 
 
680 aa  232  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  29.78 
 
 
680 aa  231  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  30.14 
 
 
680 aa  231  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  29.92 
 
 
679 aa  230  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  27.18 
 
 
679 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  26.95 
 
 
679 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  28.27 
 
 
680 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  30.41 
 
 
692 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  29.17 
 
 
705 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  29.98 
 
 
680 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  29.98 
 
 
680 aa  228  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  29.98 
 
 
682 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  28.6 
 
 
695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  26.93 
 
 
679 aa  227  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  28.08 
 
 
679 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  27.02 
 
 
679 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  28.22 
 
 
677 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  27.58 
 
 
709 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  28.22 
 
 
677 aa  226  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.88 
 
 
714 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  28.99 
 
 
675 aa  224  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  27.06 
 
 
679 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  31.42 
 
 
715 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  27.93 
 
 
727 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  28.25 
 
 
703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  29.34 
 
 
678 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  28.24 
 
 
679 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  28.76 
 
 
679 aa  219  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>