More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0893 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0893  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
271 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0782068  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
262 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 
260 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.3 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.52 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.34 
 
 
262 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  56.91 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54 
 
 
270 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
266 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
264 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
260 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
257 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
266 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
266 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
263 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 
271 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
284 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
260 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
264 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
270 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.91 
 
 
262 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
263 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
270 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.33 
 
 
261 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
260 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
259 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
261 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
263 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
263 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
264 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
266 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
261 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
262 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
261 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
261 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
263 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
264 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
263 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.06 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
262 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
264 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
267 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
262 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
251 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
259 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
273 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
269 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
262 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
265 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
263 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
259 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3470  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
261 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
265 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
258 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
259 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
283 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
265 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
263 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
265 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
276 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
263 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
267 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
268 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
259 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
259 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
259 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>