283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0644 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  100 
 
 		 414 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  60.1 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  50.86 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  55.67 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  51.45 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  50.36 
 
 		 413 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  46.11 
 
 		 384 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  43.07 
 
 		 413 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  42.82 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  44.04 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  36.14 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  36.3 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  33.97 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  35.13 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  35.24 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  35.55 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  34.31 
 
 		 404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  33 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  33.89 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  33.24 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  33.25 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  33.33 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  30.73 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  32.79 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  31.87 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  33.24 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  28.94 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  30.15 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  33.5 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  32.53 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.18 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.82 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.37 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.69 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  30.93 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.68 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  30.35 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  29.12 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.48 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  32.01 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.44 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  29.67 
 
 		 421 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.88 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  31.49 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.24 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.24 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.02 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  26.68 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.13 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.98 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  26.59 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.57 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.58 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.64 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  23.56 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.56 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  26.58 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.49 
 
 		 431 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  23.63 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.2 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  30.16 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.79 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  25.82 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.81 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  27.38 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.15 
 
 		 429 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.31 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.31 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.81 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25.9 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.59 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  26.96 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  26.32 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  24.07 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  24.79 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  23.77 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  23.78 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  23.77 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  23.77 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  23.77 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  24.65 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  23.78 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.78 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.45 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  23.78 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  27.5 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  24.65 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  27.01 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  25.95 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  24.69 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.17 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  25.63 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  26.16 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  26.12 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  23.96 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  23.96 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  23.96 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  23.96 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  23.96 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  24.79 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>