More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0327 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
328 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  88.41 
 
 
328 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  86.59 
 
 
328 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  86.89 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  82.15 
 
 
327 aa  529  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  49.39 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.18 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.2 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.9 
 
 
318 aa  276  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.99 
 
 
328 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.59 
 
 
320 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.59 
 
 
320 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.59 
 
 
320 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.2 
 
 
326 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.85 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.27 
 
 
337 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.81 
 
 
327 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.78 
 
 
349 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
336 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.62 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.26 
 
 
336 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.1 
 
 
321 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  28.93 
 
 
321 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 
345 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.48 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
331 aa  95.9  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  28.07 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.44 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.04 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  26.9 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  25.17 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.52 
 
 
333 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  25.08 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.45 
 
 
350 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.45 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  27.71 
 
 
353 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.39 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.56 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.02 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  25.62 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.75 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  26.99 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  23.94 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  26.99 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.99 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  22.8 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  25.19 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  25.91 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.73 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  26.64 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.57 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.65 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  23.46 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  22.19 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  23.17 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  26.38 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  25.27 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  24.76 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  25.08 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  25.08 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.3 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  24.51 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.15 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  27.65 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  28.43 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.56 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  27.22 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  27.22 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  24.84 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  21.58 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  23.57 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  21.58 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  21.58 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  27.67 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  24.71 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  21.09 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.09 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.94 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  31.72 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.82 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  23.93 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  26.46 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  31.18 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  22.91 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.57 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  23.77 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>