52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7058 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 104 aa  209  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  32.5 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  30.67 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  33.82 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  29.33 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  32.89 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  28.77 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  29.58 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 93 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  31.76 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  24.66 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  25.76 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  25.76 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>