45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6363 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  100 
 
 		 611 aa  1137    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  74.83 
 
 		 580 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  40.97 
 
 		 634 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  39.74 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  40.77 
 
 		 632 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  41.51 
 
 		 632 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  26.58 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  28.67 
 
 		 642 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.65 
 
 		 645 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.33 
 
 		 656 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.26 
 
 		 643 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  25.45 
 
 		 654 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  27.41 
 
 		 649 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  25.87 
 
 		 649 aa  94  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  26.03 
 
 		 645 aa  93.2  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  23.69 
 
 		 655 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.75 
 
 		 648 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.66 
 
 		 654 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  24.67 
 
 		 630 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  24.44 
 
 		 603 aa  86.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  25.51 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  24.83 
 
 		 630 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  24.89 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  24.11 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  20.47 
 
 		 626 aa  72  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  28.53 
 
 		 699 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.96 
 
 		 632 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1095 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  29.17 
 
 		 762 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  27.05 
 
 		 1331 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.96 
 
 		 677 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  25.18 
 
 		 664 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  28.05 
 
 		 682 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  28.79 
 
 		 791 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1210 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  29.08 
 
 		 602 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  27.52 
 
 		 695 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1174 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  29.29 
 
 		 761 aa  45.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.9  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.9  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.9  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.22 
 
 		 617 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>