More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4911 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  100 
 
 		 397 aa  803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  88.92 
 
 		 397 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  72.68 
 
 		 397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  70.36 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  66.16 
 
 		 401 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  62.34 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  63.59 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  61.35 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  63.38 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  63.12 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  62.86 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  60.31 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  61.7 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  62.6 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  61.44 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  60 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  60.64 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  63.12 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  59.75 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  60.61 
 
 		 395 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  61.56 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  58.97 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  55.15 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  58.21 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  57.95 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  57.96 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  56.85 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  56.06 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  48.35 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  48.97 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  50.13 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  47.98 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  47.63 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  48.53 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  45.84 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  45.84 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  47.85 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  45.57 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  46.98 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  46.98 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  44.24 
 
 		 391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  45.31 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  45.04 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  46.67 
 
 		 396 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  43.85 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  44.44 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  40 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  38.73 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.91 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.91 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  39.04 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.48 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  41.11 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  38.36 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.29 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.64 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.65 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.65 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  40.99 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  37.81 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  40.8 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  36.6 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  40.52 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.69 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.66 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.69 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.5 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  37.66 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  35.03 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.46 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.56 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  41.45 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  38.85 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.67 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  37.29 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.88 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  37.37 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.16 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  35.43 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  39.64 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  39.22 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.25 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.06 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  33.25 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.77 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  33.85 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>