More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1255 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 246 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  91.21 
 
 		 240 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  75 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2069  two component transcriptional regulator, winged helix family  74 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  71.72 
 
 		 253 aa  338  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.7 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  66.53 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  65.97 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  62.14 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  64.58 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  63.11 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  47.26 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.84 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.84 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.84 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45.99 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  47.9 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.04 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.04 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 242 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  45.97 
 
 		 267 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  45.99 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  47.46 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  47.76 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  47.64 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  48.32 
 
 		 243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  47.76 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  44.96 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  47.76 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  46.35 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  46.35 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.38 
 
 		 241 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  49.53 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  49.77 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  47.35 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  49.53 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  49.53 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 240 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  45.49 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  48.83 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  48.83 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>