109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0450 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 294 aa  547  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  92.88 
 
 		 294 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  73.26 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  61.27 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  61.86 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  63.86 
 
 		 284 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  63.77 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.34 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  64.53 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  58.68 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  58.7 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  59.59 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  59.45 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.04 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.22 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  56.1 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  64.53 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  58.72 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  51.88 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  55.98 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  46.55 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  46.55 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  43.96 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  39.66 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  41.41 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  44.67 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  39.45 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  35.82 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  36.2 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.25 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  30.45 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  43.44 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  31.2 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  29.85 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  28.62 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  29.85 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  28.62 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  28.62 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  29.48 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  29.48 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  28.94 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.39 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  28.16 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  27.4 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  30.26 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  32.96 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  28.2 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  26.38 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  27.07 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  25 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  26.37 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.33 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  34.1 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  28.31 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.78 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  33.98 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  29.72 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  35.67 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  30.92 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  30.81 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  31.76 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  32.46 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  26.24 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  31.34 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  25.88 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  32.09 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  28.9 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  34.44 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.27 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  34 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  32.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.45 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  28.91 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  27.04 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.22 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  21.3 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0670  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.407071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30.54 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  25.93 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.18 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  27.24 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.1 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  29.21 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  25.56 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  26.44 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>