200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3188 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 389 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  70.69 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.67 
 
 		 389 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.48 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.96 
 
 		 390 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.69 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.69 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.69 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.58 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.77 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32.99 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.99 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.99 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.82 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  32.99 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.76 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.68 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.77 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.63 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.44 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.6 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.08 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.24 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  30.43 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  30.21 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  29.57 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.76 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.84 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.24 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  29.63 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  30.79 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.35 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.79 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.05 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.38 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.33 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.61 
 
 		 396 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.33 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.33 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  27.91 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.6 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.75 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.18 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.24 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.72 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.72 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.51 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  31.05 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.32 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.32 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.82 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.18 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.32 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.31 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.72 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  27.52 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.31 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.27 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.72 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.17 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.38 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  26.22 
 
 		 636 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.43 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  25.06 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  25.13 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.15 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.34 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.96 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.95 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.29 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.71 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.42 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.49 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  25.87 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.16 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.83 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  25.45 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  24.81 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  26.74 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.97 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.39 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  24.87 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.02 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.39 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  23.2 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.37 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.68 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.44 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  25.4 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.86 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.59 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.58 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  24.24 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  25.2 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.28 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.48 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>