More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2348 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2348  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
389 aa  765    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0304775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2015  sodium/hydrogen antiporter  63.5 
 
 
388 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1464  hypothetical protein  53.59 
 
 
390 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1519  hypothetical protein  53.59 
 
 
390 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0567  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.9 
 
 
389 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358898  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1616  potassium/proton antiporter  54.9 
 
 
406 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0766  sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 
387 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0669  sodium/hydrogen exchanger  41.99 
 
 
386 aa  242  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.153236  hitchhiker  0.0093633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  33.43 
 
 
565 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
566 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
566 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
566 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 
558 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 
424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
595 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
548 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 
541 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
562 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 
551 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  31.05 
 
 
572 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
575 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 
561 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
572 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 
547 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 
547 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
566 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.86 
 
 
575 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
546 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 
584 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  29.83 
 
 
720 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 
576 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
561 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 
571 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 
574 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  29.33 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  30.56 
 
 
649 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 
577 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  29.82 
 
 
649 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.61 
 
 
720 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 
592 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 
649 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  29.78 
 
 
650 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
657 aa  125  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 
741 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2030  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.23 
 
 
509 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203566  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  29.69 
 
 
564 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 
757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 
606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
653 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 
741 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
581 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.78 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
606 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 
771 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
782 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
648 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
674 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
648 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 
773 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
648 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.46 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 
562 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 
747 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  29.97 
 
 
589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.97 
 
 
648 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.69 
 
 
670 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  29.22 
 
 
649 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 
688 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.3 
 
 
605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.53 
 
 
648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  28.53 
 
 
648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  29.71 
 
 
589 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 
583 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
671 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
775 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.07 
 
 
648 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  29.23 
 
 
589 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.23 
 
 
589 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 
585 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 
598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
648 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.84 
 
 
585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  29.23 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.91 
 
 
662 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  28.46 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  26.85 
 
 
624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
710 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
587 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  29.89 
 
 
564 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 
586 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.32 
 
 
562 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 
586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
666 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.79 
 
 
567 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>