More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3483 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  100 
 
 		 673 aa  1382    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.6 
 
 		 768 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  48.25 
 
 		 728 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  46.89 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.04 
 
 		 732 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  44.43 
 
 		 728 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  44.86 
 
 		 728 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  46.49 
 
 		 760 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.34 
 
 		 759 aa  526  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  46.01 
 
 		 790 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  44.77 
 
 		 726 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  45.58 
 
 		 804 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.88 
 
 		 814 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.09 
 
 		 763 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  44.17 
 
 		 726 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  44.44 
 
 		 727 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  46.26 
 
 		 770 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  45.02 
 
 		 729 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  44.01 
 
 		 739 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  44.77 
 
 		 728 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.2 
 
 		 729 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.86 
 
 		 785 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.89 
 
 		 730 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  44.77 
 
 		 728 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.89 
 
 		 730 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  44.39 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  45.72 
 
 		 721 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.78 
 
 		 765 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  42.65 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  46.02 
 
 		 778 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  43.35 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  44.46 
 
 		 727 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  44.62 
 
 		 728 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  46.75 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  43.35 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  43.35 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.81 
 
 		 725 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  43.23 
 
 		 744 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  43.35 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  45.37 
 
 		 735 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.45 
 
 		 892 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  43.35 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  43.35 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  42.63 
 
 		 638 aa  515  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  43.2 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  43.2 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  43.29 
 
 		 723 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  43.05 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.61 
 
 		 725 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  43.05 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  43.2 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  43.05 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  45.6 
 
 		 817 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  43.05 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  43.67 
 
 		 721 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  43.05 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  45.82 
 
 		 726 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  42.9 
 
 		 720 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.09 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  44.09 
 
 		 816 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  43.43 
 
 		 833 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.8 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  42.34 
 
 		 770 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  43.74 
 
 		 762 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.45 
 
 		 741 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 753 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.99 
 
 		 817 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  42.07 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  43.92 
 
 		 739 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.35 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  44.27 
 
 		 795 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.17 
 
 		 751 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  44.43 
 
 		 798 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  42.75 
 
 		 723 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 753 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.76 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 747 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 751 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  41.11 
 
 		 753 aa  505  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  40.96 
 
 		 751 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  42.53 
 
 		 721 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 751 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 		 751 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  43.5 
 
 		 720 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  42.64 
 
 		 741 aa  505  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  43.21 
 
 		 722 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.43 
 
 		 741 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4021  UvrD/REP helicase  42.11 
 
 		 848 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  45.4 
 
 		 816 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  42.81 
 
 		 720 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.01 
 
 		 751 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  44.46 
 
 		 723 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  44.75 
 
 		 799 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  41.52 
 
 		 722 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  43.06 
 
 		 722 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  42.19 
 
 		 845 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  42.44 
 
 		 847 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  44 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  43.06 
 
 		 722 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>