42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1150 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 746 aa  1528    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  34.12 
 
 		 502 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  33.9 
 
 		 502 aa  283  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  32.34 
 
 		 516 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  32.34 
 
 		 502 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  31.63 
 
 		 504 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  32.92 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 502 aa  255  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  32.79 
 
 		 600 aa  243  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  32.39 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  30.37 
 
 		 506 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  31 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  31.71 
 
 		 609 aa  231  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  30.52 
 
 		 605 aa  231  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  29.84 
 
 		 502 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 537 aa  204  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 496 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.16 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.75 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.49 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.16 
 
 		 483 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 477 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.08 
 
 		 486 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 455 aa  50.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  23.29 
 
 		 472 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  18.9 
 
 		 496 aa  47.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.54 
 
 		 502 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  24.69 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0808  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.38 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.74 
 
 		 465 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5590  NodT family outer membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 485 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.53 
 
 		 475 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 476 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 436 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 476 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  21.56 
 
 		 488 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 662 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0472  hypothetical protein  21.21 
 
 		 450 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0496  hypothetical protein  21.21 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 448 aa  43.9  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>