More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0822 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 239 aa  493  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  50.9 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  50.91 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  50.3 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 185 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.32 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  48.81 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 186 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 188 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  48.08 
 
 		 189 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 186 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  49.67 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.3 
 
 		 213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 207 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 206 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 189 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  46.43 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 186 aa  146  3e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 		 191 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.78 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 190 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 188 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 		 197 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  38.07 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 188 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  46.1 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  41.07 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  51.92 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  37.38 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  42.06 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  38 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 193 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 201 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  38 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 		 188 aa  141  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.6 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.91 
 
 		 192 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  46.41 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  51.97 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  44.91 
 
 		 210 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>