74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0279 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  96.06 
 
 
761 aa  1483    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  96.32 
 
 
761 aa  1488    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  69.3 
 
 
758 aa  1114    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  80.63 
 
 
761 aa  1301    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 
761 aa  1555    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  43.12 
 
 
707 aa  590  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  40.9 
 
 
710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  39.18 
 
 
722 aa  553  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  40.66 
 
 
611 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  41.23 
 
 
611 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  38.35 
 
 
612 aa  458  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  39.43 
 
 
612 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  40.54 
 
 
636 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  38.47 
 
 
612 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  37.29 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  36.92 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  36.77 
 
 
641 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  36.36 
 
 
634 aa  412  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.59 
 
 
735 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.77 
 
 
732 aa  219  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.06 
 
 
725 aa  217  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.77 
 
 
731 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.01 
 
 
730 aa  178  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2486  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 
688 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.172439  normal  0.868366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.97 
 
 
377 aa  54.7  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 
377 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.44 
 
 
693 aa  51.6  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  36.59 
 
 
369 aa  51.2  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  36.59 
 
 
369 aa  51.2  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  33.77 
 
 
373 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
383 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  35.06 
 
 
378 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  30.91 
 
 
121 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 
723 aa  48.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.64 
 
 
708 aa  47.4  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  28.7 
 
 
124 aa  47.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.29 
 
 
710 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.29 
 
 
717 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  32.5 
 
 
385 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  32.91 
 
 
378 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2561  DnaJ central domain protein  32.91 
 
 
519 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00796281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
375 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  32.67 
 
 
686 aa  46.6  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  27.91 
 
 
629 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  34.34 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  31.33 
 
 
378 aa  45.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  34.67 
 
 
395 aa  45.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.86 
 
 
718 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  32.91 
 
 
376 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  32.53 
 
 
376 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  33.75 
 
 
380 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  27.03 
 
 
296 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
374 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
376 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
378 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
378 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
378 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02040  DNAj protein, putative  35 
 
 
503 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  31.33 
 
 
377 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  29.87 
 
 
380 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  31.71 
 
 
386 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  33.75 
 
 
380 aa  44.3  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
376 aa  43.9  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>